125路 （白馬公園站→燕子磯站）
白馬公園 - 崗子村 - 鎖金村 - 新莊廣場東 - 長途東站(北) - 櫻鐵村 - 經五立交站 - 墨香路 - 小營村 - 合作村 - 萬壽村 - 墨香路北站 - 經五立交北站 - 神農路橋 - 神農路 - 南京特教學院 - 吉祥庵 - 勝利村 - 太平村 - 門坡村 - 燕子磯

125路區間 （化纖廠站→白馬公園站）
化纖廠 - 化纖新村 - 萬壽 - 墨香路北站 - 萬壽村 - 合作村 - 小營村 - 墨香路 - 經五立交站 - 櫻鐵村 - 長途東站(北) - 鎖金村 - 崗子村 - 白馬公園

130路 （仙居雅苑站→南京車站）
仙居雅苑 - 仙鶴茗苑 - 仙鶴門地鐵站 - 仙鶴門東 - 應天學院 - 仙林中學 - 聽泉山莊 - 雁鳴山莊 - 亞東花園城 - 堯勝村 - 徐莊軟件園 - 東楊坊 - 岔路口 - 王家灣 - 伊劉屯 - 櫻鐵村 - 長途東站(北) - 新莊廣場東 - 火車站廣場東 - 南京車站

140路 （堯化門站→北極閣站）
堯化門 - 堯辰村 - 堯化新村 - 堯化門西 - 三元祠 - 外貿倉庫 - 岔路口 - 王家灣 - 伊劉屯 - 櫻鐵村 - 長途東站(北) - 新莊廣場東 - 鎖金村 - 崗子村 - 太平門 - 北京東路 - 雞鳴寺 - 四牌樓 - 進香河 - 北極閣

141路 （南灣營站→南京車站(火車站東廣場)）
南灣營 - 文康苑 - 融康苑 - 寧康苑 - 百水芊城 - 百水芊城北門 - 馬群客運站 - 新街 - 太陽城 - 青馬 - 黃馬 - 上五旗 - 下五旗 - 岔路口 - 王家灣 - 伊劉屯 - 櫻鐵村 - 長途東站(北) - 新莊廣場東 - 火車站廣場東 - 南京車站(火車站東廣場)

162路 （萬壽停車場站→古平崗站）
萬壽停車場 - 萬壽 - 墨香路北站 - 萬壽村 - 合作村 - 小營村 - 墨香路 - 經五立交站 - 櫻鐵村 - 長途東站(北) - 公交總公司 - 青石村 - 司背後 - 虹橋 - 水佐崗 - 古平崗

309路 （悅民路站→南京火車站）
悅民路 - 麒麟門新大街 - 麒麟門 - 麒西路 - 白水橋東站 - 白水橋 - 馬群客運站 - 馬群 - 鐘山學院 - 陶家營 - 青馬 - 黃馬 - 上五旗 - 下五旗 - 岔路口 - 王家灣 - 伊劉屯 - 櫻鐵村 - 長途東站(北) - 新莊廣場東 - 火車站廣場東 - 南京火車站

50路 （仙林中心站→公交總公司(地鐵新模範馬路站)）
仙林中心站 - 衫湖西路 - 學津路 - 文樞東路 - 亞東新城區 - 仙林新村 - 學恩路 - 應天學院 - 仙鶴門東 - 仙鶴門 - 朱莊北站(燕西線) - 徐莊文化中心 - 江蘇軟件園 - 研發一區 - 徐莊軟件產業基地 - 徐莊軟件園 - 東楊坊 - 岔路口 - 王家灣 - 伊劉屯(車輛管理所) - 櫻鐵村 - 長途東站(北) - 新莊廣場東 - 公交總公司(地鐵新模範馬路站)

58路 （紅花村站→經五立交站）
紅花村 - 節制閘路南站 - 節制閘 - 節制閘路 - 白鷺東苑 - 七裡街 - 通濟門 - 瑞金路(龍蟠中路) - 逸仙橋 - 21世紀廣場 - 小營 - 九華山 - 太平門(南) - 崗子村 - 鎖金村 - 新莊廣場南 - 長途東站(北) - 櫻鐵村 - 經五立交

71路 （新港開發區站→南京車站）
新港開發區 - 江蘇瑞禾 - 堯新廣場 - 太平山公園 - 計算中心 - 烷基苯廠(仙堯路) - 堯化新村 - 堯化門西 - 海子口 - 花卉物流中心 - 堯勝村 - 徐莊軟件園 - 東楊坊 - 岔路口 - 王家灣 - 伊劉屯 - 櫻鐵村 - 長途東站(北) - 新莊廣場東 - 火車站廣場東 - 南京車站

97路 （仙林中心站→南京車站）
仙林中心站 - 學典路 - 外國語學院 - 中醫藥大學 - 杉湖東路 - 南京郵電學院 - 南京財經大學 - 文苑路 - 亞東新城區 - 文苑路西站 - 仙隱北路 - 雁鳴山莊 - 亞東花園城 - 堯勝村 - 徐莊軟件園 - 東楊坊 - 岔路口 - 王家灣 - 伊劉屯 - 櫻鐵村 - 長途東站(北) - 新莊廣場東 - 火車站廣場東 - 南京車站

D1路 （元化路站→寧工新寓站）
元化路 - 南大仙林校區 - 中醫藥大學 - 南京郵電學院 - 南京財經大學 - 亞東新城區 - 徐莊軟件園 - 長途東站(北) - 新莊廣場東 - 公交總公司 - 司背後 - 南京飯店 - 清江花苑 - 龍江花園城 - 寧工新寓

南棲線 （棲霞站→南京車站）
棲霞 - 棲霞寺 - 棲霞山 - 南象山公墓 - 戴家庫 - 南京煉油廠 - 甘家巷 - 十月村東 - 十月村 - 仙新中路 - 農場 - 前新塘 - 堯順佳園南 - 堯化門 - 堯辰村 - 堯化新村 - 堯化門西 - 三元祠 - 外貿倉庫 - 岔路口 - 王家灣 - 伊劉屯 - 櫻鐵村 - 長途東站 - 新莊廣場東 - 火車站廣場東 - 南京車站

南湯線 （南京火車站(西)→湯山汽運六隊站）
南京火車站(西) - 中央門東站 - 火車站廣場西 - 火車站廣場東 - 新莊廣場西 - 長途東站(北) - 櫻鐵村 - 伊劉屯 - 王家灣 - 岔路口 - 東楊坊 - 徐莊軟件園 - 堯勝村 - 亞東花園城 - 雁鳴山莊 - 聽泉山莊 - 仙鶴門東 - 市農科所 - 華僑公墓 - 交通技師校院東門 - 麒麟門 - 錦繡花園 - 麒麟山莊 - 西村西站 - 西村 - 東郊小鎮 - 晨光 - 金絲崗 - 孟莊 - 鎖石 - 孟北 - 墳頭 - 候家塘 - 黃粟墅 - 張肖莊 - 湯山溶洞 - 湯山西站 - 湯山 - 湯山東站 - 陳達村 - 湯山汽運六隊

遊5路 （南京火車站→明文化村站）
南京火車站 - 火車站廣場東 - 新莊廣場東 - 長途東站(北) - 櫻鐵村 - 伊劉屯 - 王家灣 - 岔路口 - 下五旗 - 上五旗 - 黃馬 - 青馬 - 陶家營 - 鐘山學院 - 馬群 - 馬群停車場 - 馬群客運站 - 百水橋 - 百水橋東站 - 麒西路 - 麒麟門西站 - 錦繡花園 - 麒麟山莊 - 西村 - 晨光 - 跨世紀物流 - 鎖石 - 孟北 - 陽山碑材 - 明文化村